除了CaCO-2细胞渗透性之外, MDCK-MDR1细胞渗透性测试是另外一个广泛用于筛选化合物渗透性的试验。MDCK-MDR1渗透性实验可以帮助研究人员了解药物的外排机制,并及早发现药物渗透性方面的潜在问题。除了肠道渗透性外,MDCK-MDR1渗透性还被发现是血脑屏障渗透性的有用预测指标。MDCK-MDR1细胞是在MDCK细胞中稳定转让表达MDR1基因(ABCB1),此基因编码表达引起多种药物抗性的外排蛋白P-gp。
如同CaCo-2细胞渗透性试验,MDCK-MDR渗透性分析通过测定从A-B以及B-A两个不同方向的转运来计算Efflux Ratio,从而可以判断一个分子是否存在P-gp介导的主动外排。